El equipo directivo del Colegio Santa Inés está conformado por la sostenedora y directora, Sor Elisa Castillo, junto al subdirector, Gabriel Vidal. A este equipo se integran además profesionales de distintas áreas clave del establecimiento: del equipo de UTP, Jennifer Becerra, Diego Esparza, Angélica Cuevas y Alfredo Zúñiga; del Programa de Mejoramiento Educativo (PME), Paula Satt; del área pastoral, Antonieta Olivares; del área de orientación, Maribel Vidal; del equipo de inspectoría, Teresa Adasme y Moira Castillo; y del área ACLE, Marisol Cuevas.
Este equipo tiene la responsabilidad de gestionar, planificar, organizar, coordinar y acompañar las diversas actividades del establecimiento, promoviendo las condiciones necesarias para su óptimo funcionamiento. Su labor se fundamenta en el Proyecto Educativo Institucional, resguardando permanentemente los sellos y valores formativos que caracterizan a nuestra comunidad educativa.